19 декабря 1982 г. в Новосибирске состоялось открытие гинекологического отделения на 30 коек. 20 декабря 1982 года в отделение были приняты первые больные.
С 1984 года отделение стало работать на 40 коек, предлагая больным весь спектр консервативной и хирургической акушерско-гинекологической помощи. В отделении постоянно шла работа по освоению новых методик аппаратной диагностики и лечения. В 1987 году здесь установлен аппарат ультразвуковой диагностики "Тошиба". В 1989 году был приобретен первый в городе аппарат для криодеструкции, за ним последовал низкочастотный ультразвук "гинетон", озонатор.
С организацией в 1991 году клиники лимфологии НИИКиЭЛ СО РАМН (директор академик РАМН Ю.И. Бородин), появились новые методики лечения воспалительных заболеваний органов малого таза, антифосфолипидного синдрома - первые больные вышли из этого отделения прямо в роддом.
С 1992 года в отделении проводятся лапароскопические операции. В 1996 году впервые в Новосибирске на базе нашего отделения была проведена эндоскопическая гистероэктомия - удаление матки. Сейчас эта операция стала обыденностью и занимает 1 час 20 минут, а первая проходила более 5 часов.
После лапароскопических операций, проведенных в отделении по поводу бесплодия, более 42% женщин познали радость материнства, этот процент стоит на уровне мирового.
С 1999 года подразделением больницы руководит кандидат медицинских наук, врач высшей квалификационной категории Т.В. Овсянникова, защитившая в 1997 году диссертацию, посвященную лечению воспалительных заболеваний женских половых органов. В настоящее время в отделении работает кандидат медицинских наук С.А. Курганов - сотрудник клиники лимфологии и врач-ординатор, врач высшей квалификационной категории B.C. Кузнецова. Естественно, что гинекологическое отделение стационара продолжает работу со специалистами поликлиники: врачом высшей квалификационной категории Л.И. Лысенко и врачом первой квалификационной категории Е.И. Окольздаевой. При поддержке специалистов гинекологического отделения, врачи поликлиники имеют возможность овладевать новыми методиками лечения воспалительных процессов. При поддержки врачей гинекологического отделения было создано отделение <<Мужское здоровье>>, в медсанчасти, в последствии это отделение стало одним из передовых в городе.
На базе отделения разработаны и внедрены методики лимфотропной и лимфостимулирующей терапии при лечении воспалительных заболеваний органов малого таза, в частности лимфотропное введение антибактериальных препаратов (что позволило добиться хорошего экономического эффекта, так как уменьшены дозы антибиотиков, кратность их введения и длительность применения); непрямые лимфостимулирующие блокады (которые позволили отказаться от применения классических для гинекологии иммунокорректоров, что также дает возможность экономично использовать медикаменты и снижает возможные побочные действия лекарственных препаратов, сохраняя их лечебные свойства).
Впервые по России, был использован аппарат низкочастотного ультразвука "Гинстон", который сейчас широко используется в гинекологической практике при лечении воспалительных заболеваний нижнего отдела женских половых органов, а также в мужском отделении для лечения таких заболеваний как простатит и аденома простаты. Здесь же, в отделении, в 1997 году был апробирован озонатор, который на сегодняшний день стал широко использоваться для лечения многих воспалительных заболеваний органов малого таза. Все данные методики научно обоснованы в работах сотрудников.
Отделение постоянно внедряет в практику все новые достижения и методики, разрабатываемые в СО РАМН, в частности в Институте лимфологии - после научно-экспериментального подтверждения эффективности предложенных разработок.
За все время работы гинекологического отделения через него прошло 31692 пациента, которые провели а стенах больницы 229678 койко-дней. Выполнено 2157 полостных операций (из них лапароскопическим доступом 1113), медицинских абортов 15664, малых гинекологических операций 10387. Активно решается проблема репродуктивного здоровья населения и эффективное лечение бесплодия различного генезиса.
Указом Президента Российской Федерации от 17 июня 1997 года заведующая гинекологическим отделением Медико-санитарной части-168 Кузнецова B.C. за заслуги перед государством и многолетний добросовестный труд награждена орденом "За заслуги перед Отечеством " 2 степени.